Hrad byl založen na
začátku 14. století a první známý majitel byl Raimund z Lichtenburka. Asi od roku
1370 patřil lipnický hrad královské koruně, a to králi Karlovi IV., který ho o
šest let později zastavil moravskému rodu pánů z Kunštátu a Poděbrad. Dalším
majitelem byl Vít z Landštejna, po něm jeho syn Vilém. Po Vilémově smrti přešel
majetek na manžela jeho dcery Čeňka z Vartemberka, který na hradě umožnil svěcení
husitských kazatelů. Roku 1425 po Čeňkově smrti přešel majetek na Oldřicha z
Rožmberka, jemuž pak Lipnici zabral táborský hejtman Jan Smil z Křemže. Roku 1436 po
husitských válkách získal Lipnici Mikuláš Trčka z Lípy. Trčkové vlastnili
lipnické panství do roku 1561, kdy hrad koupil hrabě
František z Thurnu. Zpět do majetku Trčků vrátil Lipnici roku 1594 Jan Rudolf Trčka
z Lípy a jeho rod hrad vlastnil až do roku 1634. Tehdy byl Adam z Lípy zavražděn v
Chebu a jeho majetek byl zkonfiskován. Po rodu Trčků vládl na Lipnici císařský
důstojník Matouš Vernier, který hrad dostal jako odměnu od Ferdinanda II. Jeho rodu
patřila Lipnice až do roku 1842, kdy ji koupila hrabata Trauttmannsdorffové. Tehdy už
však byl hrad neobydlen a chátral, až se z něj stala ruina. Roku 1924 koupil hrad Klub
českých turistů a od roku 1945 vlastní Lipnici stát.